Biopolttoaineet ovat nestemäisiä tai kaasumaisia liikenteessä käytettäviä polttoaineita. Biopolttoaineita ovat esim. biokaasu, bioetanoli/-metanoli ja uusiutuva diesel. Biopolttoaineet tuotetaan biomassasta.
Energiainfrayhtiö Nevel Oy suunnittelee Kotkaan biokaasulaitosta, jonka energiatuotannon vuotuinen kapasiteetti olisi noin 22 GWh. Laitos mahdollistaisi teollisuuden tuotannosta sekä kaupungilta tulevien sivuvirtojen hyödyntämisen energian arvoketjussa. Laitoksen on määrä olla käynnissä vuoden 2026 aikana. Biokaasulaitoksen rakentaminen aikanaan tulisi työllistämään arviolta kymmeniä ammattilaisia.